Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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