Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms