Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKL1Q00532 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms