Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SUMO1P63165 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms