Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms