Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms