Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA4P35212 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms