Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms