Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms