Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms