Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms