Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DMDP11532 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DMDP11532 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DMDP11532 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMDP11532 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMDP11532 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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