Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms