Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms