Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms