Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms