Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDRG4Q9ULP0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDRG4Q9ULP0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDRG4Q9ULP0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDRG4Q9ULP0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDRG4Q9ULP0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms