Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAX2Q9UIW0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAX2Q9UIW0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAX2Q9UIW0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAX2Q9UIW0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAX2Q9UIW0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAX2Q9UIW0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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