Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms