Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms