Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC180Q9P1Z9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms