Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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MIS18AQ9NYP9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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