Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC4A5Q9BY07 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms