Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMAD5Q99717 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms