Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms