Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms