Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCARF2Q96GP6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms