Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTP4A1Q93096 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTP4A1Q93096 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTP4A1Q93096 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTP4A1Q93096 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PTP4A1Q93096 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTP4A1Q93096 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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