Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms