Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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