Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms