Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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RPE65Q16518 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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RPE65Q16518 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RPE65Q16518 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RPE65Q16518 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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