Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms