Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms