Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms