Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms