Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms