Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms