Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELF3P78545 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELF3P78545 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms