Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms