Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms