Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms