Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFP01375 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFP01375 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms