Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK1O94907 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK1O94907 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK1O94907 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms