Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms