Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms