Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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C4orf47A7E2U8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C4orf47A7E2U8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C4orf47A7E2U8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C4orf47A7E2U8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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