Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB5A4FU69 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms