Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPX2Q9ULW0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms