Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms